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社保卡目前主要應用在基本醫療保險領域。一般而言，和傳統的醫保卡相比，社保卡最大的好處是可以實時結算。

以深圳市為例，以往參保人員需先行墊付，報銷過程至少需要兩三個月。對于醫院和用人單位來說，醫院門診醫療費用須由人工進行審核結算，用人單位得收集和整理費用單據后到經辦機構才能報銷，這無形之中增加了很大的工作負擔。

有了社保卡之后，參保人員不用拿著大量的現金去醫院就診了，因為社保卡實現了"零墊付"。持卡就醫后，患者只負擔個人自付、自費的醫療費用，應報銷的費用由醫療機構與醫保部門直接結算。過去往往幾個月才能解決的報銷難問題，現在可能只需要幾十秒鐘就能輕松解決了。

醫保卡所帶來的另一大弊病是各家醫院"各自為政"，不同醫院之間的就診卡無法相互通用，給患者就醫帶來不便。

社保卡則可以替代就診卡，實現就醫"一卡通"。由于社保卡具有信息記錄和信息查詢的功能，患者歷次就診的數據可以存儲起來，社保卡也就成了一份連續記錄的"電子病歷"，有利于醫生更好地了解病史和進行診治。

醫保卡可以用于平時到定點醫藥店購藥,也可以用于門診,支付住院個人承擔的部分.參加醫療保險的職工看病，是應當到當地醫療保險定點醫院就診的，別不是在任何一家醫院都可以看病。

社保卡的功能很強大，主要體現在4個方面。

醫保結算功能：參保人在定點醫療機構和定點藥店就醫購藥需要使用醫保個人賬戶基金，住院需要使用統籌基金或醫保門診單病種統籌基金時，憑社保卡實時結算相關費用。

信息查詢功能：社保卡記錄了持卡人的基礎信息和相關業務信息，持卡人可以通過服務網點、網站、12333咨詢電話查詢個人的基本信息和養老、醫療、失業、工傷、生育等各項社會保險繳費情況及待遇享受情況。

銀行金融功能：社保卡具有銀聯功能，可以作為銀行卡使用。可用于為參保人繳納各項社會保險費用，領取退休金、失業保險金、工傷保險金等各項社會保險待遇。

擴展應用功能：社保卡為大容量芯片卡，預留了擴展空間，可以搭載社會管理事務應用，逐步擴展到與人民群眾密切相關的其他社會事務領域。